- Лицензия на осуществление разработки, производства и ремонта авиационной техники. Выдана Министерством промышленности и торговли РФ.
- Лицензия на создание и производство космической техники, космических материалов и технологий, а также создание и реконструкция космической инфраструктуры, в части создания электрической системы зажигания для жидкостных ракетных двигателей космических аппаратов. Выдана Федеральным космическим агентством. 
- Лицензия на осуществление мероприятий и оказание услуг области защиты государственной тайны. Выдана Управлением ФСБ РФ по РБ.
- Лицензия на осуществление работ с использованием сведений, составляющих государственную тайну. Выдана Управлением ФСБ РФ по РБ.
- Лицензия на осуществление деятельности в области использования источников ионизирующего излучения (генерирующих). Эксплуатация, хранение рентгеновских аппаратов для контроля материалов и изделий методом рентгенографии. Выдана Федеральной службой по надзору в сфере защиты потребителей и благополучия человека.
- Лицензия на осуществление медицинской деятельности. Выдана Министерством здравоохранения РБ.
- Лицензия на осуществление образовательной деятельности по указанным в приложении образовательным программам. Выдана Управлением по контролю в сфере образования РБ.
- Сертификат об одобрении производства комплектующих изделий. Выдан Межгосударственным авиационным комитетом АР МАК.
- Свидетельство об аттестации экспериментально-исследовательского отдела по комплексной наземной отработке и испытаниям АО УНПП "Молния". Выдано Министерством обороны РФ, филиал ФГБУ "46 ЦНИИ" МО РФ.
- Система менеджмента качества АО УНПП "Молния" одной из первых в РБ сертифицирована на соответствие требованиям стандартов BS EN ISO 9001-2008 и EN 9100-2009, что подтверждается сертификатом соответствия № RU 1463-1, выданным ЗАО "Бюро Веритас Сертификейшн РУСЬ", который распространяется на разработку, производство и испытания авиационной техники.